MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 plasmid pCV56C

Total Repeats: 800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017484	TCC	2	6	8	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017484	AAATC	2	10	21	30	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017484	TGT	2	6	63	68	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017484	TCA	2	6	69	74	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017484	TCA	2	6	87	92	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017484	ACT	2	6	97	102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017484	AAT	2	6	107	112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017484	AAAGTT	2	12	128	139	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017484	CATAA	2	10	163	172	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017484	T	6	6	186	191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017484	TGA	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017484	AGG	2	6	217	222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017484	A	7	7	275	281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017484	T	7	7	350	356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017484	T	7	7	397	403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017484	AT	3	6	419	424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017484	TCAAT	2	10	611	620	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017484	A	7	7	660	666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017484	A	7	7	668	674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017484	AT	4	8	698	705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017484	A	8	8	730	737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017484	A	6	6	776	781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017484	A	6	6	798	803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017484	A	6	6	820	825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017484	TAA	2	6	873	878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017484	TCT	2	6	906	911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017484	A	7	7	965	971	100 %	0 %	0 %	0 %	385829560
28	NC_017484	GT	3	6	1008	1013	0 %	50 %	50 %	0 %	385829560
29	NC_017484	GAAA	2	8	1019	1026	75 %	0 %	25 %	0 %	385829560
30	NC_017484	AGAAA	2	10	1030	1039	80 %	0 %	20 %	0 %	385829560
31	NC_017484	TTG	2	6	1042	1047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829560
32	NC_017484	TCA	2	6	1060	1065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829560
33	NC_017484	ACA	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829560
34	NC_017484	ATTT	2	8	1158	1165	25 %	75 %	0 %	0 %	385829560
35	NC_017484	AGA	2	6	1172	1177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829560
36	NC_017484	T	7	7	1187	1193	0 %	100 %	0 %	0 %	385829560
37	NC_017484	GAC	2	6	1200	1205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829560
38	NC_017484	AAG	2	6	1228	1233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829560
39	NC_017484	A	6	6	1240	1245	100 %	0 %	0 %	0 %	385829560
40	NC_017484	A	6	6	1249	1254	100 %	0 %	0 %	0 %	385829560
41	NC_017484	TAAAGG	2	12	1280	1291	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385829560
42	NC_017484	ATT	2	6	1461	1466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829560
43	NC_017484	CGGA	2	8	1523	1530	25 %	0 %	50 %	25 %	385829560
44	NC_017484	GA	3	6	1529	1534	50 %	0 %	50 %	0 %	385829560
45	NC_017484	GAA	2	6	1748	1753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829560
46	NC_017484	ATGA	2	8	1902	1909	50 %	25 %	25 %	0 %	385829560
47	NC_017484	TAT	2	6	1910	1915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829560
48	NC_017484	AGA	2	6	1942	1947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829560
49	NC_017484	GAA	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829560
50	NC_017484	ATA	2	6	2050	2055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829560
51	NC_017484	A	6	6	2070	2075	100 %	0 %	0 %	0 %	385829560
52	NC_017484	AT	3	6	2181	2186	50 %	50 %	0 %	0 %	385829561
53	NC_017484	A	6	6	2189	2194	100 %	0 %	0 %	0 %	385829561
54	NC_017484	AGT	2	6	2202	2207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829561
55	NC_017484	ATTC	2	8	2212	2219	25 %	50 %	0 %	25 %	385829561
56	NC_017484	ACT	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829561
57	NC_017484	A	8	8	2230	2237	100 %	0 %	0 %	0 %	385829561
58	NC_017484	T	8	8	2245	2252	0 %	100 %	0 %	0 %	385829561
59	NC_017484	ACA	2	6	2262	2267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829561
60	NC_017484	ATA	2	6	2272	2277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829561
61	NC_017484	A	6	6	2277	2282	100 %	0 %	0 %	0 %	385829561
62	NC_017484	ACC	2	6	2295	2300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
63	NC_017484	CAG	2	6	2315	2320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
64	NC_017484	ACC	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
65	NC_017484	CAG	2	6	2348	2353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
66	NC_017484	ACC	2	6	2361	2366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
67	NC_017484	CAG	2	6	2381	2386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
68	NC_017484	ACC	2	6	2394	2399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
69	NC_017484	CAG	2	6	2414	2419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
70	NC_017484	ACC	2	6	2427	2432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
71	NC_017484	CAG	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
72	NC_017484	ACC	2	6	2460	2465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
73	NC_017484	CAG	2	6	2480	2485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
74	NC_017484	ACC	2	6	2493	2498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
75	NC_017484	CAG	2	6	2513	2518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
76	NC_017484	ACC	2	6	2526	2531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
77	NC_017484	CAG	2	6	2546	2551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
78	NC_017484	ACC	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385829561
79	NC_017484	CAG	2	6	2567	2572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829561
80	NC_017484	T	7	7	2579	2585	0 %	100 %	0 %	0 %	385829561
81	NC_017484	CAA	2	6	2644	2649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829561
82	NC_017484	GTT	2	6	2676	2681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829561
83	NC_017484	AGA	2	6	2682	2687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829561
84	NC_017484	ATAAA	2	10	2816	2825	80 %	20 %	0 %	0 %	385829561
85	NC_017484	AAG	2	6	2831	2836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829561
86	NC_017484	AAT	2	6	2842	2847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829561
87	NC_017484	A	6	6	2857	2862	100 %	0 %	0 %	0 %	385829561
88	NC_017484	TAT	2	6	2917	2922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017484	GTT	2	6	3049	3054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017484	ATT	2	6	3073	3078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017484	T	6	6	3077	3082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017484	A	6	6	3090	3095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017484	T	6	6	3101	3106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017484	A	6	6	3119	3124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017484	A	6	6	3142	3147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017484	ATC	3	9	3215	3223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829562
97	NC_017484	T	6	6	3234	3239	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
98	NC_017484	T	7	7	3249	3255	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
99	NC_017484	TA	3	6	3313	3318	50 %	50 %	0 %	0 %	385829562
100	NC_017484	ATC	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829562
101	NC_017484	T	6	6	3354	3359	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
102	NC_017484	TTTTG	2	10	3397	3406	0 %	80 %	20 %	0 %	385829562
103	NC_017484	GTTTGA	2	12	3556	3567	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385829562
104	NC_017484	GTT	2	6	3630	3635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829562
105	NC_017484	CTT	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829562
106	NC_017484	A	6	6	3801	3806	100 %	0 %	0 %	0 %	385829562
107	NC_017484	TTTC	2	8	3814	3821	0 %	75 %	0 %	25 %	385829562
108	NC_017484	TCT	2	6	3834	3839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829562
109	NC_017484	TTTCTT	2	12	3853	3864	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385829562
110	NC_017484	T	7	7	3867	3873	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
111	NC_017484	CTTT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	385829562
112	NC_017484	T	7	7	3936	3942	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
113	NC_017484	T	6	6	3981	3986	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
114	NC_017484	T	7	7	4003	4009	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
115	NC_017484	T	6	6	4046	4051	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
116	NC_017484	GTC	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829562
117	NC_017484	GTTT	2	8	4135	4142	0 %	75 %	25 %	0 %	385829562
118	NC_017484	AAT	2	6	4183	4188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829562
119	NC_017484	GGAC	2	8	4218	4225	25 %	0 %	50 %	25 %	385829562
120	NC_017484	AAT	2	6	4226	4231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829562
121	NC_017484	TTTC	2	8	4267	4274	0 %	75 %	0 %	25 %	385829562
122	NC_017484	ATTT	2	8	4306	4313	25 %	75 %	0 %	0 %	385829562
123	NC_017484	AAT	2	6	4382	4387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829562
124	NC_017484	TCA	2	6	4464	4469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829562
125	NC_017484	T	7	7	4509	4515	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
126	NC_017484	T	6	6	4524	4529	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
127	NC_017484	TCA	2	6	4563	4568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829562
128	NC_017484	TGAA	2	8	4574	4581	50 %	25 %	25 %	0 %	385829562
129	NC_017484	T	6	6	4624	4629	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
130	NC_017484	TCA	2	6	4636	4641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829562
131	NC_017484	GAA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829562
132	NC_017484	CCGTT	2	10	4681	4690	0 %	40 %	20 %	40 %	385829562
133	NC_017484	T	6	6	4720	4725	0 %	100 %	0 %	0 %	385829562
134	NC_017484	T	6	6	4761	4766	0 %	100 %	0 %	0 %	385829563
135	NC_017484	ATT	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829563
136	NC_017484	TGAT	2	8	4853	4860	25 %	50 %	25 %	0 %	385829563
137	NC_017484	ATT	2	6	4861	4866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829563
138	NC_017484	ATA	2	6	4910	4915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829563
139	NC_017484	TTTC	2	8	5001	5008	0 %	75 %	0 %	25 %	385829563
140	NC_017484	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829563
141	NC_017484	TCT	2	6	5030	5035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829563
142	NC_017484	T	6	6	5053	5058	0 %	100 %	0 %	0 %	385829563
143	NC_017484	ATT	2	6	5084	5089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829563
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278	NC_017484	C	6	6	9839	9844	0 %	0 %	0 %	100 %	385829571
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